从头设计路线，我国科学家建立蛋白质设计新方法

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IT之家 2 月 10 日消息，据中国科大官网，中国科学技术大学刘海燕教授、陈泉副教授团队采用数据驱动策略，开辟出一条全新的蛋白质从头设计路线。IT之家了解到，相关成果以“用于蛋白质设计的以主链为中心的神经网络能量函数”为题于北京时间 2 月 10 日发表于 Nature。据介绍，蛋白质是生命的基础，是生命功能的主要执行者，其结构与功能由氨基酸序列所决定。目前，能够形成稳定三维结构的蛋白质，几乎全部是天然蛋白质，其氨基酸序列是长期自然进化形成。在天然蛋白结构功能不能满足工业或医疗应用需求时，想要得到特定的功能蛋白，就需要对其结构和序列进行设计。中国科学技术大学相关团队长期深耕计算结构生物学方向的基础研究和应用基础研究。刘海燕教授、陈泉副教授团队十余年来致力于发展数据驱动的蛋白质设计方法，建立并实验验证了给定主链结构设计氨基酸序列的 ABACUS 模型，进而发展了能在氨基酸序列待定时从头设计全新主链结构的 SCUBA 模型（图 1